MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 2

Total Repeats: 77240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010676	GC	3	6	265	270	0 %	0 %	50 %	50 %	187918715
2	NC_010676	GGC	2	6	288	293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918715
3	NC_010676	GCG	2	6	313	318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918715
4	NC_010676	CGG	2	6	327	332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918715
5	NC_010676	CG	3	6	385	390	0 %	0 %	50 %	50 %	187918715
6	NC_010676	CAC	2	6	401	406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918715
7	NC_010676	CGA	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918715
8	NC_010676	TGA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918715
9	NC_010676	TGG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918715
10	NC_010676	GTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918716
11	NC_010676	GTT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918716
12	NC_010676	GCG	2	6	757	762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918716
13	NC_010676	GACGTT	2	12	804	815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187918716
14	NC_010676	GCC	2	6	822	827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918716
15	NC_010676	GCT	2	6	858	863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918716
16	NC_010676	GCC	2	6	870	875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918716
17	NC_010676	CCG	2	6	881	886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918716
18	NC_010676	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918716
19	NC_010676	TGT	2	6	1047	1052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918717
20	NC_010676	TCG	2	6	1056	1061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918717
21	NC_010676	GTT	2	6	1108	1113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918717
22	NC_010676	GTT	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918717
23	NC_010676	CTT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918717
24	NC_010676	TGAAGT	2	12	1200	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918717
25	NC_010676	GAC	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918717
26	NC_010676	TAG	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918717
27	NC_010676	GCC	2	6	1237	1242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918717
28	NC_010676	GTT	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918717
29	NC_010676	ATC	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918717
30	NC_010676	GAC	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
31	NC_010676	CA	3	6	1837	1842	50 %	0 %	0 %	50 %	187918718
32	NC_010676	GCT	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
33	NC_010676	CGA	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
34	NC_010676	GCG	3	9	1909	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
35	NC_010676	GGC	2	6	1945	1950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
36	NC_010676	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
37	NC_010676	ACC	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918718
38	NC_010676	GCA	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
39	NC_010676	CAA	2	6	2089	2094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187918718
40	NC_010676	GGA	2	6	2107	2112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187918718
41	NC_010676	TCGGCG	2	12	2118	2129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187918718
42	NC_010676	TCG	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
43	NC_010676	GC	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
44	NC_010676	CAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918718
45	NC_010676	TGC	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
46	NC_010676	GC	3	6	2416	2421	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
47	NC_010676	GC	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
48	NC_010676	ACG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
49	NC_010676	AAGTGA	2	12	2532	2543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187918718
50	NC_010676	GAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187918718
51	NC_010676	CG	3	6	2679	2684	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
52	NC_010676	CCA	2	6	2731	2736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918718
53	NC_010676	CA	3	6	2758	2763	50 %	0 %	0 %	50 %	187918718
54	NC_010676	GC	3	6	2765	2770	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
55	NC_010676	CGGC	2	8	2792	2799	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
56	NC_010676	GGCG	2	8	2820	2827	0 %	0 %	75 %	25 %	187918718
57	NC_010676	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
58	NC_010676	GC	3	6	2876	2881	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
59	NC_010676	GC	4	8	2906	2913	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
60	NC_010676	GGT	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918718
61	NC_010676	GCAG	2	8	3031	3038	25 %	0 %	50 %	25 %	187918718
62	NC_010676	GGC	2	6	3064	3069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
63	NC_010676	TCG	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
64	NC_010676	ACCGC	2	10	3095	3104	20 %	0 %	20 %	60 %	187918718
65	NC_010676	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
66	NC_010676	CGC	2	6	3111	3116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
67	NC_010676	CGC	2	6	3147	3152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
68	NC_010676	CGG	2	6	3153	3158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
69	NC_010676	GCA	2	6	3164	3169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
70	NC_010676	CGC	2	6	3199	3204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
71	NC_010676	GGCGC	2	10	3302	3311	0 %	0 %	60 %	40 %	187918718
72	NC_010676	GGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
73	NC_010676	CGA	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
74	NC_010676	GGCC	2	8	3436	3443	0 %	0 %	50 %	50 %	187918718
75	NC_010676	GCC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
76	NC_010676	GGT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918718
77	NC_010676	TGG	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918718
78	NC_010676	CAC	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918718
79	NC_010676	ACT	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918718
80	NC_010676	CGT	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
81	NC_010676	GCC	2	6	3616	3621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
82	NC_010676	CGC	2	6	3628	3633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918718
83	NC_010676	TCGGA	2	10	3675	3684	20 %	20 %	40 %	20 %	187918718
84	NC_010676	TGG	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918718
85	NC_010676	TGC	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
86	NC_010676	TGCG	2	8	3762	3769	0 %	25 %	50 %	25 %	187918718
87	NC_010676	CGG	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918718
88	NC_010676	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918718
89	NC_010676	ACG	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918718
90	NC_010676	GAGCG	2	10	3864	3873	20 %	0 %	60 %	20 %	187918718
91	NC_010676	GAC	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918719
92	NC_010676	ACGC	2	8	3980	3987	25 %	0 %	25 %	50 %	187918719
93	NC_010676	GCC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
94	NC_010676	GCC	2	6	4046	4051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
95	NC_010676	CATG	2	8	4086	4093	25 %	25 %	25 %	25 %	187918719
96	NC_010676	CGG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
97	NC_010676	CAG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918719
98	NC_010676	CGG	2	6	4135	4140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
99	NC_010676	CCTT	2	8	4215	4222	0 %	50 %	0 %	50 %	187918719
100	NC_010676	CGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
101	NC_010676	CCA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918719
102	NC_010676	TGG	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918719
103	NC_010676	GCC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
104	NC_010676	ACGGT	2	10	4343	4352	20 %	20 %	40 %	20 %	187918719
105	NC_010676	GGT	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918719
106	NC_010676	CTG	2	6	4385	4390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
107	NC_010676	CGT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
108	NC_010676	CG	4	8	4411	4418	0 %	0 %	50 %	50 %	187918719
109	NC_010676	TTTG	2	8	4427	4434	0 %	75 %	25 %	0 %	187918719
110	NC_010676	GGC	2	6	4469	4474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
111	NC_010676	GC	3	6	4528	4533	0 %	0 %	50 %	50 %	187918719
112	NC_010676	TGA	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918719
113	NC_010676	GTC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
114	NC_010676	CTG	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
115	NC_010676	GAAC	2	8	4592	4599	50 %	0 %	25 %	25 %	187918719
116	NC_010676	CGG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
117	NC_010676	GGC	2	6	4715	4720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
118	NC_010676	GCG	2	6	4738	4743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
119	NC_010676	GCG	2	6	4777	4782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918719
120	NC_010676	CGC	2	6	4835	4840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
121	NC_010676	GC	3	6	4859	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	187918719
122	NC_010676	GAGC	2	8	4867	4874	25 %	0 %	50 %	25 %	187918719
123	NC_010676	GCT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
124	NC_010676	CTG	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
125	NC_010676	GAC	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918719
126	NC_010676	CCG	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
127	NC_010676	GAAGC	2	10	5071	5080	40 %	0 %	40 %	20 %	187918719
128	NC_010676	CGC	2	6	5101	5106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
129	NC_010676	CTGCG	2	10	5123	5132	0 %	20 %	40 %	40 %	187918719
130	NC_010676	CCG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918719
131	NC_010676	GTC	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
132	NC_010676	ACC	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187918719
133	NC_010676	TGA	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918719
134	NC_010676	TGC	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918719
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261	NC_010676	GAG	2	6	11298	11303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187918724
262	NC_010676	GC	4	8	11310	11317	0 %	0 %	50 %	50 %	187918724
263	NC_010676	CCT	2	6	11330	11335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187918724
264	NC_010676	CGA	2	6	11397	11402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918724
265	NC_010676	CGC	2	6	11415	11420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918724
266	NC_010676	GC	3	6	11458	11463	0 %	0 %	50 %	50 %	187918724
267	NC_010676	GCC	2	6	11481	11486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918724
268	NC_010676	CGA	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918724
269	NC_010676	CGC	2	6	11577	11582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918724
270	NC_010676	GC	3	6	11626	11631	0 %	0 %	50 %	50 %	187918724
271	NC_010676	CGC	2	6	11639	11644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918724
272	NC_010676	CAA	2	6	11662	11667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187918724
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274	NC_010676	CGG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918724
275	NC_010676	GCA	2	6	11733	11738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918724
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277	NC_010676	GCT	2	6	11832	11837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918724
278	NC_010676	CG	3	6	11864	11869	0 %	0 %	50 %	50 %	187918724
279	NC_010676	CGC	2	6	11964	11969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918724
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283	NC_010676	ATC	2	6	12179	12184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918724
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287	NC_010676	CG	5	10	12415	12424	0 %	0 %	50 %	50 %	187918725
288	NC_010676	TGGTCG	2	12	12447	12458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187918725
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291	NC_010676	GC	3	6	12501	12506	0 %	0 %	50 %	50 %	187918725
292	NC_010676	GC	3	6	12620	12625	0 %	0 %	50 %	50 %	187918725
293	NC_010676	GC	3	6	12632	12637	0 %	0 %	50 %	50 %	187918725
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304	NC_010676	CTGCAA	2	12	13175	13186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187918725
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389	NC_010676	GCG	2	6	16891	16896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918727
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